细胞的组织特异性转录本

[alamin447]

的假设对于高表达的基因可能并不成立。对全长 mRNA 转录本测序的持续兴趣也促进了第三代测序技术的繁荣，该技术可以确定外显子连接性甚至全长 mRNA，特别是对于具有复杂 AS 模式或具有数千种不同亚型的基因 [51 , 52 ]。最近，Glinos 等人。[ 53]利用长读长比较转录本结构的组织特异性，发现小脑半球、肝脏和成纤维比例最高[ 53 ]。但由

于其通量低，第三代测序只能提供相对较少的读数，导致复杂Telegram 用户号码列表剪接基因的相对亚型表达定量不准确。更重要的是，该平台高昂的测序费用也可能成为许多研究人员望而却步的障碍。因此，在基因组规模上准确、直接地确定同一转录本内外显子的连接性仍然很困难。然而，正如我们在这项研究中发现的那样，大量的外显子具有很


高的剪接复杂性（图 1 ）C），剪接复杂性差异反映了组织之间的剪接变化（图 4A）。因此，本研究中使用的剪接熵是一个暂定但不可或缺的指标，以利用短读长高通量 RNA-seq 数据来研究外显子剪接复杂性。 有趣的是，外显子的连锁复杂性与基因年龄、进化速率、基因功能和相互作用网络中的基因连接性密切相关。尽管因果关系仍需进一步研究，但剪接复杂性与基因特征之间的相关性